首個山羊基因組圖譜完成

首個山羊全基因組圖譜在《自然?生物技術》（Nature Biotechnology）雜志在線發(fā)表。

　　本研究由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成。

　　山羊是最早被人類馴化的動物之一。已有證據表明，山羊最早起源于中亞細亞一帶的角羊，目前在全球范圍內尤其是中國、印度及其他發(fā)展中國家被廣泛飼養(yǎng)。從人類文明起始，山羊便為人類提供肉、奶、皮、毛等，逐漸成為農業(yè)和經濟發(fā)展的重要支柱。此外，山羊現在還可作為生物醫(yī)學研究的模型，用于復雜性狀的遺傳學基礎研究。盡管其重要性如此之高，由于缺乏參考基因組，目前對山羊的遺傳育種研究還略顯滯后，而山羊基因組測序對于遺傳標記輔助育種、改善山羊的經濟性狀具有重要作用。

　　在本研究中，科研人員對一只雌性云南黑山羊進行了全基因組測序。

　　通過比較基因組分析，研究人員發(fā)現山羊與牛的親緣關系較近，二者大約在2300萬年前分化。此外，山羊基因組中約有44個基因受到正選擇，其中7個與免疫相關，這與在�；�因組中是一致的；另外還有3個垂體功能相關的基因發(fā)生快速進化，這可能與產奶量、胚胎發(fā)育速度以及羊毛變化等相關。隨后，研究人員進一步分析了山羊基因家族擴張與收縮情況。他們發(fā)現3個與味覺受體相關的基因亞家族發(fā)生擴張，而僅有1個亞家族收縮，推測這可能與山羊的覓食能力相關；同時還發(fā)現鐵蛋白重鏈多肽-1基因（FTH1）擴張至人類的7倍、牛的2倍，并推測這可能與山羊強大的解毒及覓食能力相關。因為鐵蛋白在鐵離子螯合、解毒和貯存中發(fā)揮著重要作用。

　　哺乳動物的毛發(fā)是由皮膚毛囊生成的高度角質化的組織，有兩種不同類型的毛囊，初級毛囊存在于所有哺乳動物中僅產生被毛，而次級毛囊則存在于山羊等動物中產生羊絨和細羊絨，而羊絨纖維主要從絨山羊獲得。雖然中國具有悠久的羊絨生產歷史，并且是全球最大的羊絨生產國，但是對于羊絨形成和發(fā)育的分子機制卻知之甚少。

　　在本研究中，研究人員對初級毛囊和次級毛囊進行了轉錄組研究，以鑒定不同毛囊中的分子變化。

　　華大基因副院長、該項目負責人徐訊表示，“通過結合第二代測序技術與全基因組酶切圖譜技術完成的山羊基因組圖譜，為分子標記輔助山羊育種奠定了基礎，將促進反芻類的比較基因組學的研究。對絨山羊初級毛囊和次級毛囊轉錄組的比較分析，將為絨山羊羊絨品質的改良提供新方向�！�